Исследование методом секвенирования по Сэнгеру является «золотым стандартом» для определения последовательности нуклеотидов, используемым в молекулярно-генетической диагностике для поиска конкретных мутаций.

Изменения в структуре гена можно выявить при сравнении последовательности нуклеотидов пробанда с референсным геномом человека.

Результатом исследования является заключение о наличии или об отсутствии (в гомо-, гетеро- или гемизиготном состоянии) искомого варианта в геноме пациента.

Цель генетического анализа по Сэнгеру

Исследование методом секвенирования по Сэнгеру применяется после проведения полного секвенирования экзома, генома или секвенирования отдельных генов для подтверждения выявленных патогенных, вероятно-патогенных вариантов или вариантов с неизвестной клинической значимостью, а также для установления статуса носителя, когда у кого-либо из родственников уже был выявлен вариант, и его координаты в геноме известны.

Риски и ограничения секвенирования по Сэнгеру

Существует вероятность естественного процесса разрушения клеток крови и ДНК, что может потребовать повторного забора биологического материала для исследования.
С учетом процесса проведения исследования, его многоэтапностью, срок проведения исследования в ООО «Медикал Геномикс» может составлять до 30 рабочих дней.
Исследование методом секвенирования по Сэнгеру позволяет выявить наличие/отсутствие вариантов в целевом участке ДНК, однако не может обнаружить какие-либо изменения ДНК вне исследуемого региона.
Секвенирование по Сенгеру дает возможность прочитать последовательность ДНК не более 1000 пар оснований за один раз. С помощью данного метода можно детектировать изменения, если они проявляются не менее чем в 15-20% исследуемой ДНК.

Необходимо сдать не менее 4 мл венозной крови. При необходимости лечащий врач может порекомендовать взять кровь у двух и более членов вашей семьи (родители или братья и сестры) в зависимости от опции исследования.

В течение 1 рабочего дня после оформления услуги мы отправляем вам курьерский пакет.
В него входят:

подробная инструкция по взятию биоматериала;

направление на исследование, необходимое для проведения анализа;

пробирка с ЭДТА

За 1 рабочий день до планируемой даты транспортировки биоматериала вы сообщаете нам удобные дату, время и адрес забора (через мессенджер или иным согласованным способом).
Мы подтверждаем детали и направляем курьера.

После взятия образца необходимо в течение 1 дня передать курьеру:

комплект с биоматериалом,
оригинал направления на исследование,
подписанное согласие на обработку персональных данных.

Если по каким-либо причинам вы не смогли передать набор курьеру в указанные сроки, вы можете отправить его самостоятельно на адрес лаборатории.

Если передачу биоматериала оформляет ваш представитель, он должен предъявить документы, подтверждающие полномочия.

Все расходные материалы, предоставленные вместе с набором, являются оборотной тарой и подлежат возврату — либо вместе с биоматериалом, либо при прекращении действия услуги.

Причины неверной постановки диагноза и неполучения результата исследования. Риски и ограничения секвенирования по Сэнгеру:

Существует вероятность естественного процесса разрушения клеток крови и ДНК, что может потребовать повторного забора биологического материала для исследования.
Исследование методом секвенирования по Сэнгеру позволяет выявить наличие/отсутствие вариантов в целевом участке ДНК, однако не может обнаружить какие-либо изменения ДНК вне исследуемого региона.
Секвенирование по Сэнгеру дает возможность прочитать последовательность ДНК не более 1000 пар оснований за один раз.
С помощью данного метода можно детектировать изменения, если они проявляются не менее чем в 15-20% исследуемой ДНК.
Пpи нaличии в aнaмнeзe пepeливaния кpoви/aллoгeннoй тpaнcплaнтaции кocтнoгo мoзгa вoзмoжнo пoлyчeниe нeтoчнoгo peзyльтaтa. B тaкoм cлyчae нeoбxoдимo зapaнee cooбщить лeчaщeмy вpaчy и гeнeтичecкoй лaбopaтopии o фaктe пepeливaния кpoви/aллoгeннoй тpaнcплaнтaции кocтнoгo мoзгa для пpинятия peшeния o цeлecooбpaзнocти пpoвeдeния тecтиpoвaния и выбope видa биoмaтepиaлa для тecтиpoвaния.

Данный анализ выявляет:

Патогенные мутации. Это те мутации которые изменяют ген и являются причинами врожденных заболеваний, влияют на развитие наследственных заболеваний и иногда приводят к гибели эмбриона или плода.
Вероятно патогенные мутации - те, которые могут быть вероятной причиной наследственного или врожденного заболевания.
Вариант с неизвестной (неопределенной) генетической значимостью. Variant of uncertain significance (VOUS). Эти мутации возможно имеют отношение к фенотипу. Для уточнения статуса патогенности таких мутаций и их отношения к заболеванию у пациента могут потребоваться дополнительные анализы. Носительство мутаций рецессивных генов. Родители могут быть здоровы и не иметь фенотипических признаков, однако есть риск рождения детей с наследственным заболеванием.

Исследование методом секвенирования по Сэнгеру применяется после проведения полного секвенирования экзома, генома или секвенирования отдельных генов / панелей генов методом NGS для подтверждения выявленных патогенных, вероятно-патогенных вариантов или вариантов с неизвестной клинической значимостью, а также для установления статуса носителя, когда у кого-либо из родственников уже был выявлен вариант, и его координаты в геноме известны.

Показания для полного секвенирования экзома

Как тест первой линии, это исследование может быть назначено:

Для диагностики генетически гетерогенных заболеваний
При атипичных клинических проявлениях, не указывающих на конкретное заболевание (у пациентов с задержкой в развитии, расстройством аутистического спектра, эпилепсией)
При сложной диагностике в неонатальном периоде
Для определения статуса носительства наследственных заболеваний Также исследование назначается в случае отягощенной наследственности, если другие генетические исследования не позволили установить диагноз.

Можно ли сдать этот анализ здоровому человеку?

Да, можно. Даже если у человека нет никаких признаков заболеваний и осложнений, он может сделать такой анализ ДНК. Результаты исследования дадут пациенту понимание где и в каких генах есть мутации.

Такой скрининг на носительство мутаций подойдет для людей, которые планирую беременность.

Вторичные находки

Во время анализа секвенирования могут быть обнаружены некоторые варианты, которые не связаны с текущими симптомами пациента (вторичные находки). Тем не менее, эта информация может иметь важные последствия для здоровья пациента и членов их семей.

Вторичные находки могут быть включены в отчет пациента. Наше секвенирование экзома включает все гены, перечисленные в списке генов ACMG (Американский колледж медицинской генетики и геномики). Мы учитываем последние рекомендации по генетическому тестированию, чтобы улучшить качество наших заключений. Список генов ACMG (скачать)

Анализ проводится по венозной крови пациента. С помощью метода секвенирования NGS на полногеномном секвенаторе MGISEQ-2000 (BGI inc.) точность прочтения каждого фрагмента ДНК для >85% прочтений достигает 99,98%. Средняя глубина покрытия ≥100 x, это значит, что каждая буква в геноме была прочитана минимум 100 раз.
Исследование методом секвенирования по Сэнгеру является «золотым стандартом» для определения последовательности нуклеотидов, используемым в молекулярно-генетической диагностике для поиска конкретных мутаций. Изменения в структуре гена можно выявить при сравнении последовательности нуклеотидов пробанда с референсным геномом человека.

венозная кровь участников исследования, собранная c использованием расходных материалов, предоставляемых нашей лабораторией. Образец крови также может быть собран в пробирку c ЭДТА (фиолетовая крышка), приобретенную клиентом.

Хранение и транспортировка материала производится в срок до 48 часов в охлажденном виде (при температуре +4 +8 °С).

Клиент самостоятельно осуществляет забор биоматериала, либо обращается в медицинскую организацию.

Для забора биоматериала может использоваться набор, который предоставила наша лаборатория, либо пробирка ЭДТА (фиолетовая крышка), приобретенная вами самостоятельно.

Внимание! Вы самостоятельно обеспечиваете соблюдение инструкции по забору биоматериала.

В случае обращения клиента к нашему партнеру он самостоятельно несет ответственность за действия или бездействие медицинской организации.

Также обратите внимание: если биоматериал предоставлен некачественно (например, с нарушением условий хранения или транспортировки), это может увеличить срок выполнения анализа или сделать его проведение невозможным.

Мы не храним биоматериал после оказания услуги.